В версии решения Deluxe 5.0. появилось окно подтверждения города. необходимо оно, если у Вас настроена разная информация для разных городов, чтобы информация сразу была актуальной, а не подставлялась по умолчанию
Перед обновлением решения сделайте полную резервную копию сайта и обновите 1С-Битрикс до последней актуальной версии, иначе часть функций может работать некорректно
Если Вам не нужно данное окно, то отключить его можно в настройках параметров компонента гео позиции. Включите режим правки и наведите на область выбора города в шапке сайта Откройте параметры компонента и установите параметр "Отключить окно подтверждения города:"